For Isei

tracy/tools/lance_tracy3.sh

+#!/bin/sh
+# 30 Septembre 2010, Laurent S. nadolski, Synchrotron SOLEIL
+#Option pour voir les details
+#set -x
+
+if [ $# -ne 1 ]         # si le nombre de parametres n'est pas 1
+then                    # affiche l'usage
+    echo Tracy3 not valid
+    echo Missing paremeter file
+    echo Use: $0 parameterfile 
+    exit 1
+fi
+
+## creation d'un nom unique pour l'executable
+NUM=`date '+%d%m%y%H%M%s'`
+DIR=$HOME/resultat_tracy/exe
+NOM=$DIR/soltracy_$NUM
+# take file name and remove .prm extension if exists
+INPUT_FILE=$(basename $1 .prm).prm
+SCRIPT_FILE=$DIR/$(basename $1 .prm)_$NUM
+echo excecutable filename: $NOM
+echo input parameter filename: $INPUT_FILE
+
+# generate name for excutable
+cp soltracy $NOM
+# generate name for input parameters
+cp  $INPUT_FILE $SCRIPT_FILE.prm
+
+## creation d'un nom unique pour le job PBS
+JOB=$DIR/job.$NUM
+
+#########################
+## creation du script PBS
+echo "#PBS -l walltime=72:00:00,mem=400mb,nodes=1:ppn=1
+#PBS -N Tracy
+#PBS -m abe
+#PBS -j eo
+# IMPORTANT : mettre ici le repertoire ou l'on execute tracy
+#             le chemin doit etre absolu
+set -x
+
+### va dans /tmpdir/PBS du noeud ou le job est excecute
+cd \$TMPDIR
+
+### Excecute le job : ici soltracy
+$NOM $SCRIPT_FILE
+
+### Sauvegarde des resultats *.out
+uname -a
+pwd
+ls -l
+DIRSAVE=$HOME/resultat_tracy
+mkdir \$DIRSAVE/result.\$PBS_JOBID
+mv *.out \$DIRSAVE/result.\$PBS_JOBID
+mv *.dat \$DIRSAVE/result.\$PBS_JOBID
+
+rm $NOM
+mv $SCRIPT_FILE.prm \$DIRSAVE/result.\$PBS_JOBID/$INPUT_FILE
+
+### email pour dire ou sont les resultats du job
+CMD=\"mail -s \\\"Job \$PBS_JOBID\\\" \"`cat $HOME/.forward`
+ssh isei \"\$CMD\" <<EOF
+Bonjour,
+
+Le demon du Cluster vous informe que votre job est termine:
+Les resultats sont dans \$DIRSAVE/result.\$PBS_JOBID
+
+A bientot,
+
+Le Cluster.
+EOF
+" > $JOB
+## creation du script PBS
+#########################
+
+### lance la commande PBS
+#qsub -q redhat9 -l nodes=1:ppn=1:redhat9 $JOB
+qsub $JOB
+
+### fait le menage
+rm $JOB